Pramuka di MTsN 2 Kota Banjarmasin terbagi menjadi dua yaitu putra dan putri. Bagi seluruh kelas VII diwajibkan mengikuti ekstrakurikuler ini selama satu tahun. Setelah mereka naik ke kelas VIII kesempatan masih terbuka luas bagi yang ingin melanjutkan. Biasanya latihan pada hari sabtu sore pukul 15.00 WITA.